Ему приписывают пророчество, сделанное им и касающееся всех будущих пап римских, начиная с Целестина II, избранного в 1143 году, и вплоть до последнего, некоего Петра Римлянина. Святой Малахия написал 112 коротких описаний на латыни, в конце которых он предсказал после правления последнего папы Страшный суд и разрушение города на семи холмах.